數字PCR儀主要分為三大類:標準PCR(終點PCR)、實時定量PCR(qPCR)以及數字PCR(dPCR)。前兩者大家都很熟悉,而后者是這兩年冉冉升起的新星。
數字PCR儀主要是產生大量的核酸序列供后續實驗使用,比如測序、克隆,或僅僅是為了在凝膠上看看有沒有合適的條帶。
qPCR則是實時定量靶序列,通常被用來測定生物分子的豐度,而不是生成終產物
數字PCR儀也是定量的,但并非實時。反應發生在大量的微小分區中。這些分區很小,其中每個可能包含0或1個DNA分子。通過計算陽性反應的數量,研究人員能夠真正定量DNA。這比qPCR更為靈敏,也不需要標準曲線。
對于標準PCR儀和定量PCR儀之間的選擇,研究人員通常都心里有數。不過,說到qPCR和dPCR之間的選擇,研究人員就沒那么有把握了,有時也需要幫助。這個選擇通常取決于研究人員的應用和他們想要回答的問題不過對于高通量應用,qPCR則更實際。
大多數用戶以96孔形式運行PCR反應,通常使用0.2mlPCR管。當然也還有其他形式,適合更高的通量或不同的樣品量,如0.5ml管。允許不同大小的PCR管插在同一模塊上。當同一實驗室中的不同人在進行不同的PCR檢測時,這特別有用。
一些PCR儀允許樣品模塊更換成兩個或多個更小的模塊。這種模塊化的系統就好像多臺熱循環儀一樣,能提高效率。比比科技的雙模塊設計讓研究人員能夠在不同模塊上運行不同的循環步驟。同樣,PCR儀包含四個熱模塊,能夠獨立運行四個循環步驟。據介紹,這種設計帶來了靈活性,也明顯縮短了優化時間。